Carlos Javier Morales nace en Santa Cruz de Tenerife el 7 de septiembre de 1967. En su isla natal vive hasta los diecisiete años, cuando se traslada a Madrid para estudiar COU y luego la carrera de Filología Hispánica, en la Universidad Complutense. Obtiene esta Licenciatura en 1990 y el Grado de Doctor en 1993, con una tesis titulada La poética de Martí y su contexto, dirigida por el Prof. Luis Sáinz de Medrano.
Durante estos años de estudiante universitario y de postgraduado forma parte de diversos grupos de literatura y pensamiento, algunos impulsados por su propia iniciativa, como una tertulia celebrada cada sábado en el Café Rey Fernando, de la Calle Prim, entre 1992 y 1995, a la que asisten numerosos amigos poetas y lectores de poesía. Allí leen y critican, con total libertad, textos de otros autores no presentes, lo cual permite ir creando en todos los participantes un criterio poético sólido y plural a la vez. Por esta tertulia, en ocasiones especialmente señaladas, pasan grandes poetas de la lengua castellana, como José Hierro, Francisco Brines, Pablo Armando Fernández, Félix Grande, Luis Antonio de Villena, Luis García Montero, Pedro Shimose, etc. Con algunos de ellos Carlos Javier iniciará una larga amistad.
En 1994 gana el Premio de Poesía “Villa de Martorell” con su primer libro, El pan más necesario, editado por Seuba Ediciones en septiembre de ese mismo año.
En 1995 Carlos Javier se traslada a Logroño para enseñar Literatura Española e Hispanoamericana en la Universidad de La Rioja. Allí sigue trabajando en su poesía y en sus libros de investigación y crítica. Es ésta una época de congresos internacionales y de estancias como profesor invitado en el extranjero. En este aspecto, cabe destacar su semestre como profesor invitado en la Universidad de Münster (Alemania), en la primavera y verano de 1998, así como su viaje a Chile en 1999, representando a España en el congreso “El poeta joven y su libro”, organizado por la Fundación Premio Nobel Gabriela Mistral.
Ese año de 1999 regresa a Madrid para trabajar como profesor en la Universidad San Pablo-CEU. Allí permanece hasta el año 2002, en que, por diversas circunstancias laborales, obtiene por oposición la plaza de profesor de Lengua y Literatura Españolas en la enseñanza secundaria. Actualmente es profesor de estas materias en el Instituto Anaga, de su ciudad natal, tarea que hace compatible con su creación poética y la escritura de ensayos filosóficos y literarios. Entre estos últimos destacan sus numerosos libros y artículos sobre la poesía contemporánea de España e Hispanoamérica, José Martí, el modernismo hispánico y, en general, la literatura del fin-de-siglo XIX en lengua española.
Entre otras muchas publicaciones periódicas, ha colaborado frecuentemente en Cuadernos hispanoamericanos, Clarín, Letras Libres y www.poesiadigital.es Desde enero de 2009 hasta julio de 2011 fue director de esta última revista, www.poesiadigital.es